De acuerdo con el tercer informe de fiscalización de la Cuenta Pública 2018, la Auditoría Superior de la Federación detectó este posible quebranto por irregularidades en la construcción de la tercera línea de este transporte público, consistente en pagos injustificados.
El posible daño patrimonial consiste en pagos indebidos por nueve millones 880 mil 822 pesos y 35 millones 823 mil 635 pesos por el concepto "Acarreo en camión de material mixto, primer kilómetro, carga mecánica".
El órgano de fiscalización superior federal señaló que estos pagos se dieron sin acreditar el volumen de material de acarreos producto de excavación con el reporte de control de acarreos en camión y con los tickets de salida de material de la obra y las entradas del material a los predios autorizados para su disposición final.
La Auditoría informó que el gobierno de Gali Fayad realizó una deficiente planeación del proyecto en cuanto al estudio de mecánica de suelos para la terminal Periférico Ecológico y Boulevard Valsequillo, pues se proyectó la colocación de concreto rígido como superficie de rodamiento en toda el área de la terminal, sin embargo, se implementó un pavimento flexible con concreto asfáltico.
La ASF también detalló que el gobierno de Puebla no acreditó las autorizaciones en materia de impacto y riesgo ambiental emitidas por la Secretaría de Desarrollo Rural Sustentable y Ordenamiento Territorial estatal para la estación de autoconsumo de gas natural de la terminal Valsequillo.
Asimismo, no se informó a la Secretaría de Desarrollo Rural, Sustentabilidad y Ordenamiento Territorial sobre las modificaciones en sus productos o subproductos, así como los volúmenes de residuos generados como excedente en el contrato.
En el informe de junio de 2019, la ASF detectó un posible daño patrimonial por 106 millones 135 mil 974 pesos en la construcción de la tercera línea de RUTA.
